Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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