Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn4Q9D6I3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn4Q9D6I3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms