Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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