Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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