Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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