Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nsmce3Q9CPR8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms