Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms