Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms