Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan1Q99J59 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms