Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Cldn16Q925N4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Cldn16Q925N4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Cldn16Q925N4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Cldn16Q925N4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Cldn16Q925N4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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