Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cacng8Q8VHW2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cacng8Q8VHW2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms