Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
GcaQ8VC88 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
GcaQ8VC88 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms