Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Lrrtm1Q8K377 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Lrrtm1Q8K377 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Lrrtm1Q8K377 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Lrrtm1Q8K377 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Lrrtm1Q8K377 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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