Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ssh3Q8K330 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms