Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Csnka2ipQ8CH19 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Csnka2ipQ8CH19 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Csnka2ipQ8CH19 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csnka2ipQ8CH19 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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