Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nhsl1Q8CAF4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms