Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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