Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp38Q8BW70 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp38Q8BW70 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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