Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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