Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gpc2Q8BKV1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms