Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms