Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ubash3bQ8BGG7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms