Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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H2-M10.4Q85ZW8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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