Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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