Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SnupnQ80W37 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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