Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AknaQ80VW7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms