Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Avl9Q80U56 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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