Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Actn1Q7TPR4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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