Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim12Q78RX3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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