Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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