Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms