Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms