Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smchd1Q6P5D8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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