Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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