Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trim28Q62318 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trim28Q62318 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim28Q62318 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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