Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sema3cQ62181 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms