Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PcolceQ61398 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PcolceQ61398 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PcolceQ61398 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PcolceQ61398 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PcolceQ61398 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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