Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms