Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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