Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms