Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms