Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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