Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms