Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hace1Q3U0D9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms