Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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