Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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