Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc162pQ0VG85 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc162pQ0VG85 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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