Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cntnap5bQ0V8T8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms