Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ttc21bQ0HA38 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ttc21bQ0HA38 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ttc21bQ0HA38 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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