Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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